分子細胞修飾学 斉藤研究室 Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

平成29年度 (2017年4月〜2018年3月)

いろいろな個性と出会えて、有意義な一年を過ごすことが出来ました。新しい研究の方針や方法論を確立した1年でした。
それぞれの個性を生かして、今後もご活躍ください。

H29年度ラボメンバー
教員 斉藤 寿仁 教授
大学院博士課程(前期)1年 柳井 良平
4年生 鉾 結衣、鎗水 秀虎、村上 智洋、飯星 悠(米国留学中)
Junior Research Fellow(3年) 岡田 咲耶
エーゲ大学、トルコ、博士課程2年(IJEP留学生)TAKIR Gizem Gulevin

スケジュール

4月

04/03 研究室オリエンテーション+ミーティング+掃除+
    お花見#1 at 北キャンパス:鎗水、高鉾、村上、岡田
04/04 入学式
04/05 4年生&院生の履修ガイダンス
04/10 JC#1 斉藤+ミーティング+掃除:柳井、鎗水、高鉾、
    岡田 Stress-Triggered Phase Separation Is an Adaptive,
    Evolutionarily Tuned Response. Riback JA, Katanski CD,
    Kear-Scott JL, Pilipenko EV, Rojek AE, Sosnick TR,
    Drummond DA. Cell. 2017 Mar 9;168(6):1028-1040.
    04/12 飯星さん米国留学Farewell Party at 白川河川敷 &
    お花見BBQ#2

【04/14: 21時26分熊本地震第1波(マグネチュード6.5; 最大震度7.0)から1周年】・・・黙とう
【04/16: 1時25分熊本地震第2波(マグネチュード7.3; 最大震度6強)から1周年】・・・黙とう

04/17 JC#2 柳井+ミーティング+掃除:鎗水、高鉾、村上
    Transfer of mitochondria from astrocytes to neurons after stroke. Hayakawa K, Esposito E, Wang X, Terasaki Y,
    Liu Y, Xing C, Ji X, Lo EH. Nature. 2016 Jul 28;535(7613):551-5.
04/21(金) 3年生歓迎会 at くすのき会館
04/24 ミーティング+掃除:柳井、高鉾、村上、岡田
04/25 奥野先生(山形大)・早川さん(並木精密機器)来熊

5月

05/01 H29キックオフカンファレンス
    (PR2#1)+ミーティング+掃除:柳井、
    鎗水、高鉾、村上、岡田
05/01 グリーンカレー+鶏もも+パインで
    ランチョン
05/08 JC #3 鎗水:柳井、高鉾、村上、
    岡田+ミーティング+掃除:
    C. elegans neurons jettison protein
    aggregates and mitochondria under
    neurotoxic stress. Melentijevic I,
    Toth ML, Arnold ML, Guasp RJ, Harinath G, Nguyen KC, Taub D, ParkerJA, Neri C, Gabel CV, Hall DH, Driscoll M.
    Nature. 2017 Feb 16;542(7641):367-371. doi: 10.1038/nature21362.

05/09-11 学生実習(前半)
05/16-18 学生実習(後半)
05/15 JC#4 村上:鎗水、高鉾、
    岡田+ミーティング+掃除:
    Compartment-specific aggregases
    direct distinct nuclear and
    cytoplasmic aggregate deposition.
    Miller SB, Ho CT, Winkler J,
    Khokhrina M, Neuner A, Mohamed MY, Guilbride DL, Richter K, Lisby M, Schiebel E, Mogk A, Bukau B. EMBO J.
    2015 Mar 12;34(6):778-97. doi: 10.15252/embj.201489524.(170306継続)
05/22 JC#5 高鉾:岡田、鎗水*、村上*+ミーティング+掃除:
    Amyloid-binding compounds maintain protein homeostasis during ageing and extend lifespan. Alavez S, Vantipalli MC,
    Zucker DJ, Klang IM, Lithgow GJ. Nature. 2011 Apr 14;472(7342):226-9.
05/29 PR2#2 柳井・高鉾、鎗水、村上、岡田+ミーティング+掃除

6月

06/05 JC #6 岡田+ミーティング+掃除:柳井、村上、鎗水、高鉾
    Communication by Extracellular Vesicles: Where We Are and Where We Need to Go. Tkach M, Thery C. Cell.
    2016 Mar 10;164(6):1226-32. doi: 10.1016/j.cell.2016.01.043. Review

06/12 JC#7斉藤:柳井、村上、鎗水、高鉾、岡田+
    ミーティング+掃除
    Diurnal Oscillations in Liver Mass and Cell Size
    Accompany Ribosome Assembly Cycles. Sinturel F,
    Gerber A, Mauvoisin D, Wang J, Gatfield D,
    Stubblefield JJ, Green CB, Gachon F, Schibler U.
    Cell. 2017 May 4;169(4):651-663.e14.
    doi: 10.1016/j.cell.2017.04.015.
06/13-16 the 2nd meeting on SMC proteins〜Chromosomal
    organizers from bacteria to human, Akayu, Yamagata,
    Japan
    ・P49: The SUMO-modification and ubiquitin-proteasome
    systems in controlling mitotic chromosomes and nuclear
    protein homeostasis. Hisato Saitoh
    ・P68: Analysis on nuclear and chromosome deformability
    using human myeloid cell line HL-60. Ryohei Yanai and
    Hisato Saitoh
06/19 JC#8 柳井:村上、鎗水、高鉾、岡田+ミーティング+掃除
    Protein cross-linking by chlorinated polyamines and
    transglutamylation stabilizes neutrophil extracellular traps.
    Csomos K, Kristof E, Jakob B, Csomos I, Kovacs G,
    Rotem O, Hodrea J, Bagoly Z, Muszbek L, Balajthy Z,
    CsŐsz E, Fesus L. Cell Death Dis. 2016 Aug 11;7(8):e2332.
    doi: 10.1038/cddis.2016.200.
06/21 SMCmeeting報告会 by 斉藤
06/22 SMCmeeting報告会 by 柳井
06/26 PR2#3柳井、村上、鎗水、高鉾、岡田+ミーティング+掃除:

7月

07/03 JC#9鎗水:柳井、村上、高鉾、岡田+ミーティング+掃除
    An Ancient, Unified Mechanism for Metformin Growth Inhibition in C. elegans and Cancer. Wu L, Zhou B, Oshiro-
    Rapley N, Li M, Paulo JA, Webster CM, Mou F, Kacergis MC, Talkowski ME,Carr CE, Gygi SP, Zheng B, Soukas AA.
    Cell.2016 Dec 15;167(7):1705-1718.e13. doi: 10.1016/j.cell.2016.11.055.
07/10 JC#10村上:柳井、鎗水、高鉾、岡田+ミーティング+掃除
    ATP as a biological hydrotrope. Patel A, Malinovska L, Saha S, Wang J, Alberti S, Krishnan Y, Hyman AA. Science.
    17 May 19;356(6339):753-756. doi: 10.1126/science.aaf6846. 07/17 JCお休み(海の日)
07/18(火) JC#11高鉾:柳井、村上、高鉾、岡田+ミーティング+掃除
    Ki-67 acts as a biological surfactant to disperse mitotic chromosomes. Cuylen S, Blaukopf C, Politi AZ, Muller-
    Reichert T, Neumann B, Poser I, Ellenberg J, Hyman AA, Gerlich DW. Nature. 2016 Jul 14;535(7611):308-12.
    doi: 10.1038/nature18610. Epub 2016 Jun 29.
07/19 研究室セミナーat C216杉本真也先生(東京慈恵会医科大学医学科細菌学講座・講師):高鉾、村上
07/24 JC#12岡田:柳井、村上、鎗水、高鉾+ミーティング+掃除:
    Applying systems-level spectral imaging and analysis to reveal the organelle interactome. Valm AM, Cohen S,
    Legant WR, Melunis J, Hershberg U, Wait E, Cohen AR, Davidson MW, Betzig E, Lippincott-Schwartz J. Nature. 2017
    Jun 1;546(7656):162-167. doi: 10.1038/nature22369. Epub 2017 May 24.
07/27 研究室セミナーat C216 内村康寛先生(滋賀医科大学解剖学講座・助教):高鉾
07/31 PR2#4+ミーティング+掃除:柳井、高鉾、岡田

8月

08/07 ミーティング+掃除(8月中はJCとPR2はお休みします)
08/14-15 大学一斉休業
08/21 ミーティング+掃除(8月中はJCとPR2はお休みします)
08/23−24 大学院入試
08/28 ミーティング+掃除(8月中はJCとPR2はお休みします)

9月

09/04 9:30-ミーティング+掃除(9月中はJCはお休みします)
09/15(金) 9:30-ミーティング+掃除(9月中はJCはお休みします)
09/18 敬老の日(祝日)-09/22の週はミーティングしません
09/25 PR2#5+ミーティング+掃除 
09/29 Takirさん来日(出迎え:岡田、高鉾at Fukuoka Airport)

10月


10/02 10:00〜 ミーティング+掃除
10/03 or 04 or 05 Lunch with Gizem+ラボの集合写真
10/09 体育の日(祝日)のためJCはお休み
10/10 ミーティング+掃除+
    Gizem Gülevin Takırさんセミナー”Life in Turkey”+ Lunch
10/14 江津湖花火大会
10/16 JC#1斉藤+ミーティング+掃除:
    柳井、村上、鎗水、高鉾、岡田、Takir
    Liquid droplet formation by HP1α suggests a role for phase
    separation in heterochromatin. Larson AG, Elnatan D, Keenen
    MM, Trnka MJ, Johnston JB, Burlingame AL, Agard DA,
    Redding S, Narlikar GJ. Nature. 2017; 547(7662):236-240.
    doi: 10.1038/nature22822.
10/20 3年生研究室紹介
10/23 JC#2村上+ミーティング+掃除:
    柳井、村上、鎗水、高鉾、岡田、Takir
    Cytosolic proteostasis through importing of misfolded proteins
    into mitochondria. Ruan L, Zhou C, Jin E, Kucharavy A,
    Zhang Y, Wen Z, Florens L, Li R. Nature. 2017 Mar
    16;543(7645):443-446.doi: 10.1038/nature21695.
10/30 PR2#6+ミーティング+掃除:
    柳井、村上、鎗水、高鉾、岡田、Takir

11月


11/06 JC#3鑓水:高鉾、岡田、Takir、*柳井、*村上+ミーティング
    +掃除
    ER-mitochondria contacts couple mtDNA synthesis with
    mitochondrial division in
    human cells. Lewis SC, Uchiyama LF, Nunnari J. Science. 2016
    Jul
    15;353(6296):aaf5549. doi: 10.1126/science.aaf5549.
11/13 JC#4岡田:柳井、鎗水、Takir+ミーティング+掃除
    DNA Cross-Bridging Shapes a Single Nucleus from a Set of
    Mitotic
    Chromosomes. Samwer M, Schneider MWG, Hoefler R,
    Schmalhorst PS,
    Jude JG, Zuber J, Gerlich DW. Cell. 2017 Aug 24;170(5):956-
    972.e23.
    doi: 10.1016/j.cell.2017.07.038.
11/20 JC#5高鉾:鑓水・村上・岡田・Takir・*柳井+ミーティング
    +掃除
    Nucleolar expansion and elevated protein translation in
    premature aging.
    Buchwalter A, Hetzer MW. Nat Commun. 2017 Aug 30;8(1):328.
    doi:
    10.1038/s41467-017-00322-z.
11/24 クリスマスツリー作製開始
11/27 ミーティング+掃除:鑓水・高鉾・村上・岡田、・Takir
    PR2#7:柳井・鑓水・高鉾・村上・岡田、・Takir
    新メンバー初参加+ピザパーティー

12月


12/04 ConBio発表予行:高鉾、岡田、斉藤
    +柳井・鑓水・Takir・宮崎、小林、深井、徳永
    +ミーティング+掃除
    Practice for research presentation at the ConBio conference
    (Yui and Saya)+Lab meeting +clean-up
12/06-09 ConBio2017 at Kobe
    (Yui, Saya, Gulevin-on behalf of I-i, Saitoh)[3P-0273]
    Anthracycline系トポイソメラーゼII阻害剤Aclarubicinと
    Doxorubicinの細胞毒性の一端はミトコンドリア呼吸阻害に由来
    する
    〇飯星 悠1、石原 孝也2、石原 直忠2、斉藤 寿仁3
    (1.熊大・理・生物、2.久留米大・分子生命科学研・高分子化学、
    3.熊大・院・先端科学・生物)[3P-0273]
    Cytotoxicity of the anthracycline topoisomerase inhibitors,
    Aclarubicin and Doxorubicin, is due, at least in part,
    to impairment of mitochondria respiration
    〇Haruka Iihoshi1, Takaya Ishihara2, Naotada Ishihara2,
    Hisato Saitoh3 (1.Biology Course, Fac. of Sci., Kumamoto Univ.,
    2.Dept. of Protein Biochem., Inst. of Life Sci., Kurume Univ.,
    3.Dept. of Biol., Grad. Sch. of Sci. Tech., Kumamoto Univ. )
    [3P-0274] アミロイド結合性蛍光色素Thioflavin T(ThT)による
    生細胞の構造観察と細胞増殖の制御
    〇高鉾 結衣1、斉藤 寿仁1,2
    (1.熊大・理・生物、2.熊大・院・先端科学・生物) [3P-0274]
    Live cell imaging and cellular regulation by the amyloid-binding
    fluorescence compound Thioflavin T (ThT)
    〇Yui Takahoko1, Hisato Saitoh1,2 (1.Biology Course, Fac. Sci.,
    Kumamoto Univ., 2.Dept. of Biol., Grad. Sch. of Sci. Tech., Kumamoto Univ.) [3P-0275]
    Giant Plasma Membrane Vesicles(GPMVs)の大量調整と生化学解析および情報伝達キャリアーとしての利用
    〇岡田 咲耶1、袰川 智吏1、斉藤 寿仁1,2 (1.熊大・理・生物、2.熊大・院・先端科学・生物) [3P-0275]
    Large scale preparation and biochemical characterization of Giant Plasma Membrane Vesicles(GPMVs)
    〇Saya Okada1, Satoshi Yankawa1, Hisato Saitoh1,2 (1.Biology Course, Fac. Sci., Kumamoto Univ., 2.Dept. of Biol.,
    Grad. Sch. of Sci. Tech., Kumamoto Univ. ) [3P-0276(4LT01-05)]
    SUMOとユビキチンによる不完全ポリペプチド鎖の核内凝集と離散の制御 松尾 花佳1、魚住 直毅1、松本 蛍1、
    〇斉藤 寿仁1,2 (1.熊大・理・生物、2.熊大・院・先端科学・生物) [3P-0276(4LT01-05)]
    Regulation of defective polypeptides by nuclear aggregation and the SUMO-ubiquitin pathway Haruka Matsuo1,
    Naoki Uozumi1, Hotaru Matsumoto1,
    〇Hisato Saitoh1,2 (1.Biology Course, Fac. Sci., Kumamoto Univ., 2.Dept. of Biol., Grad. Sch. of Sci.
    Tech., Kumamoto Univ.)
12/12 ConBio報告会+柳井プロゼミ予行+ミーティング+掃除Meeting Report of the ConBio2017
    +Practice for research presentation (Roy) +Lab meeting +clean-up :柳井・鑓水・高鉾・村上・岡田・Takir・宮崎、
    小林、深井、徳永
12/16(土) プロゼミ(柳井)
12/16(Sat)Research presentation (Roy)
12/18 PR2#8柳井・鑓水・高鉾・村上・岡田・Takir・宮崎、小林、深井、徳永+ミーティング+掃除
12/18 PR2#8+meeting +clean-up
12/23 Lab Party at 和
12/26 大掃除(3−4限)
12/26 meeting +clean-up

3年生・新メンバー(H30年度の卒研生)
徳永皓介・宮崎航平・深井裕太・小林桃子

2018 A happy new year 1月

01/09(火)10:00初詣 First visit to Fujisakigu-Shrine(藤崎宮:(first visit to shrine of this year, which is a Japanese traditional custom) →3年生卒研テーマ決定 12:50~JC#6 by Roy柳井:鑓水、高鉾、村上、岡田、Takir、小林、宮崎、徳永、深井+Lab meeting and Clean-up Role of YAP/TAZ in mechanotransduction. Dupont S, Morsut L, Aragona M, Enzo E, Giulitti S, Cordenonsi M, Zanconato F, Le Digabel J, Forcato M, Bicciato S, Elvassore N, Piccolo S. Nature. 2011 Jun 8;474(7350):179-83. doi: 10.1038/nature10137.
01/13-14センター入試Entrance Examination
01/16JC#7by Gizem Gulevin Tak?r:柳井、高鉾、村上、岡田、Takir、小林、宮崎、深井+Lab meeting and Clean-up PML isoform II plays a critical role in nuclear lipid droplet formation. Ohsaki Y, Kawai T, Yoshikawa Y, Cheng J, Jokitalo E, Fujimoto T. J Cell Biol. 2016 Jan 4;212(1):29-38. doi: 10.1083/jcb.201507122.
01/23PR2+Lab meeting and Clean-up:岡田、Takir、小林、宮崎、徳永、深井、柳井、鑓水、高鉾、村上
01/26Acceptance dead-line of graduation research thesis (研究室への卒研提出〆切→査読開始)
01/30卒研発表の研究室内予行#1 Practice for the presentation of graduation research #1 +Lab meeting and Clean-up: 鑓水、高鉾、村上、岡田、Takir、柳井、小林、宮崎、徳永、深井

2月

02/02卒論提出〆切 Dead line of acceptance of Graduation Research Paper
02/06卒研発表の研究室内予行#2 Practice for the presentation of graduation research #2 +Lab meeting and Clean-up
02/08-09卒研発表会Presentation of Graduation Research ・鎗水秀虎「MitotrackerRedCMXROSを用いた核とミトコンドリアオルガネラ間における情報交換の解析」
・村上智洋「脱分化誘導剤ReversineとGFP-H2B恒常発現細胞を用いたヒストン分配と微小管阻害に関する研究」
・鉾結衣「Thioflavin Tの細胞老化に対する影響の解析〜RNA結合と細胞増殖の制御の観点から〜」
→居酒屋「一球」で打ち上げLab party at the Japanese-style bar IKKYU
02/13JC with three JASSO Scholar Students presented by JJ+Lab meeting and Clean-up
Resetting the Yeast Epigenome with Human Nucleosomes. Truong DM, Boeke JD. Cell. 2017 Dec 14;171(7):1508-1519.e13. doi: 10.1016/j.cell.2017.10.043. Epub 2017 Nov 30
02/15-16修士発表会 Master Research Presentation
→02/16 追いコンat くすのき会館 Farewell Party at KUSUNOKI Hall
02/19(Mon) 12:50~ 大学院面接試験予行(岡田+Takir、小林、宮崎、徳永、深井)JRF research presentation (Saya) +Lab meeting and Clean-up
02/21大学院入試Examination of the early entry to graduate school
02/26(Mon)PR2+Practice for Research Presentation (Gulevin) + Lab meeting and Clean-up:岡田、Takir、柳小林、宮崎、徳永、深井

3月

03/01 Research presentation by the students in JASSO program (Gulevin gave her research presentation).
03/05 ミーティング+掃除Lab meeting & Clean-up:Takir、高鉾、小林、宮崎、徳永、深井
03/12 ミーティング+掃除Lab meeting & Clean-up:小林、宮崎、徳永、深井
03/19 ミーティング+掃除Lab meeting & Clean-up:Takir、小林、宮崎、深井
03/25
(Sun)
熊本大学および大学院卒業式・修了式at 県立劇場 Graduation Ceremony at KENRITU Ceremony Hall
*高鉾さん、鑓水さん、卒業おめでとう!Yui and Hidy, congratulations on your graduation.
03/26 10:30~ミーティング+掃除Lab meeting & Clean-up::岡田、徳永
03/27 お花見BBQ+柳井さん送別会at 白川河川敷BBQ party for cherry blossom viewing and farewell party for Mr. Roy Yanai at Shirakawa-riverside area