分子細胞修飾学 斉藤研究室 Molecular and Cellular Modification Saitoh LABORATORY

平成28年度 (2016年4月〜2017年3月)

学部学生だけで研究室を運営したのは今年が初めてでしたが、皆さんがしっかり研究を発展させてくださったおかげで、なんとか活動を継続することが出来ました。それぞれの個性を生かして、今後もご活躍ください。

H28年度ラボメンバー
4年 飯星 悠、 中間 大希、 松尾 花佳、柳井 良平、袰川 智吏
Junior Research Fellow(2年) 岡田 咲耶

スケジュール

4月

03/30 お花見BBQ at 白川河川敷公園

04/04 研究室ガイダンス:飯星、松尾、袰川、柳井、中間、岡田
    JRF春休み研究プロジェクトの成果報告・岡田
    ミーティング+掃除
04/06 2・3・4年生履修ガイダンス
04/08 授業開始・履修登録開始(卒業研究10単位+生物環境
    セミナーA/Bの4単位の登録を忘れないように)
04/11 JC #1 斉藤:飯星、袰川、柳井
    Long-Lived Binding of Sox2 to DNA Predicts Cell Fate
    in the Four-Cell Mouse Embryo. White MD, Angiolini JF,
    Alvarez YD, KaurG, Zhao ZW, Mocskos E, Bruno L, Bissiere S,
    Levi V, Plachta N. Cell. 2016 Mar 24;165(1):75-87. doi:
    10.1016/j.cell.2016.02.032.
    ミーティング+掃除:飯星、袰川、柳井
04/14 (木)21時26分 マグネチュード6.5; 最大震度7.0
    研究室に居た柳井君と袰川君が対応してくれて、大きな問題
    はありませんでした。機転を利かせて、冷蔵庫などのドアを
    ガムテープで固定してその後の余震に備えた行為は、その後
    に予期せぬ)本震が来ることを考えると極めて有効でした。

04/15 (金)後片付け+ラボメンバー全員の安否を
    確認
04/16 (土)1時25分 マグネチュード7.3;
    最大震度6強
04/18 JC #2 柳井:ミーティング+掃除
    *延期します
04/22 3年生歓迎会 at くすのき会館
    *延期します
04/25 ミーティング+掃除
    *キャンセルします
04/28 ミーティング+掃除+キックオフ(PR2+計画発表)+打ち上げ
    *延期します
連休明けの完全復帰を目指してがんばるぞ!

5月

05/09 JC #2 柳井:松尾、袰川+
    中間ミーティング+ 掃除
    Neutrophils sense microbe size and
    selectively release neutrophil extracellular
    traps in response to large pathogens.
    Branzk N,Lubojemska A,Hardison SE,
    Wang Q,Gutierrez MG,Brown GD,
    Papayannopoulos V.
    Nat Immunol. 2014 Nov;15(11):1017-25.
05/10-12 05/17-19
    学生実習(3年生A/Bグループ)
    →0712-14と0719-21に予定変更
05/13 H28年度キックオフシンポ+PR2 飯星・
    袰川・中間・松尾・柳井+素敵!
    ステーキdinner at C216

05/16 JC#3 松尾:飯星、袰川、柳井、中間ミーティング+掃除
     Cytoplasmic protein aggregates interfere with
     nucleocytoplasmic transport of protein and RNA. Woerner AC,
     Frottin F, Hornburg D, Feng LR, Meissner F, Patra M,
     Tatzelt J, Mann M, Winklhofer KF, Hartl FU, Hipp MS.
     Science. 2016 Jan 8;351(6269):173-6.
05/23 JC#4 中間:延期
    ミーティング+掃除:飯星、松尾、袰川

05/30 JC#5 袰川:飯星、松尾
     A haploid genetic screen identifies the major facilitator domain containing 2A (MFSD2A) transporter as a key
     mediator in the response to tunicamycin. Reiling JH, Clish CB, Carette JE, Varadarajan M, Brummelkamp TR,
     Sabatini DM. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 Jul 19;108(29):11756-65. doi: 10.1073/pnas.1018098108
     ミーティング+掃除:

6月

06/06 JC#6 飯星:袰川、柳井、中間、松尾*
    +ミーティング+掃除
    Chemical profiling of the genome with anti-
    cancer drugs defines target specificities.
    Pang B, de Jong J, Qiao X, Wessels LF,
    Neefjes J. Nat Chem Biol. 2015
    Jul;11(7):472-80.
    doi: 10.1038/nchembio.1811.
06/13 JC 中間:飯星、袰川、松尾*、柳井*
    +ミーティング+掃除
    Ubiquitination independent of E1 and E2
    enzymes by bacterial effectors. Qiu J,
    Sheedlo MJ, Yu K, Tan Y, Nakayasu ES,
    Das C, Liu X, Luo ZQ. Nature. 2016 May 5;533(7601):120-4. doi: 10.1038/nature17657.
06/15 PR² 斉藤/柳井/松尾/中間/袰川/飯星
    青葉の会Dinner
06/20 #7 松尾:飯星:袰川、中間、柳井*
    +ミーティング+掃除
    Modified STAP conditions facilitate bivalent fate decision between pluripotency and apoptosis in Jurkat T-l
    ymphocytes. Kim JY, Cheng X, Alborzinia H, Wolfl S. Biochem Biophys Res Commun. 2016 Apr 15;472(4):585-91.
    doi: 10.1016/j.bbrc.2016.03.031.
06/27 #8 柳井:松尾、飯星、袰川、中間+ミーティング+掃除
    Inhibitory effects of extracellular self-DNA: a general biological process? Mazzoleni S, Carteni F, Bonanomi G,
    Senatore M, Termolino P, Giannino F, Incerti G, Rietkerk M, Lanzotti V, Chiusano ML. New Phytol. 2015
    Apr;206(1):127-32. doi: 10.1111/nph.13306.
    Growth inhibition by self-DNA: a phenomenon and its multiple explanations. Duran-Flores D, Heil M. New Phytol.
    2015 Aug;207(3):482-5. doi: 10.1111/nph.13542.

7月

07/04 JC#9 中間:柳井、松尾、袰川、飯星+ミーティング+掃除
     Stem cell function and stress response are controlled by protein synthesis. Blanco S, Bandiera R, Popis M,
     Hussain S, Lombard P, Aleksic J, Sajini A, Tanna H, Cortes-Garrido R, Gkatza N, Dietmann S, Frye M. Nature.
     2016 Jun 15;534(7607):335-40. doi: 10.1038/nature18282.
07/09 生物学コース+3年生歓迎会 at くすの木会館
07/11 PR² 中間、松尾、柳井、袰川、飯星+ミーティング+掃除

夏の味覚のランチョンパーティー

07/12-14 3年生学生実習(Aグループ)
07/19 ミーティング+掃除:松尾・袰川・飯星・*中間

07/19-21 3年生学生実習(Bグループ)
07/25 JC#11飯星 ミーティング+掃除:松尾・袰川・中間・*柳井
     Coexisting Liquid Phases Underlie Nucleolar Subcompartments. Feric M, Vaidya N, Harmon TS, Mitrea DM,
     Zhu L, Richardson TM, Kriwacki RW, Pappu RV, Brangwynne CP. Cell. 2016 Jun 16;165(7):1686-97.
     doi: 10.1016/j.cell.2016.04.047. Epub 2016 May 19.

8月

07/04 JC#10 袰川:松尾・中間・飯星・*柳井 +ミーティング+掃除
     A scalable strategy for high-throughput GFP tagging of endogenous human proteins. Leonetti MD, Sekine S,
     Kamiyama D, Weissman JS,
     Huang B. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Jun 21;113(25):E3501-8. doi: 10.1073/pnas.1606731113.
08/05 PR2 中間・松尾・袰川・柳井・飯星
08/05 ビアパーティー with カレー&サラダ&種無しブドウ

*暑いときは体を休めましょうか。7〜8〜9月中に長期のお休み(3日以上)をとる場合は、行先と連絡先などをお知らせください。

9月

09/05 ミーティング+掃除:松尾・飯星・袰川・中間・岡田
09/12 ミーティング+掃除:飯星・袰川・中間・柳井・岡田
09/14-15 集中講義 生物環境特別講義G:木村暁先生(国立遺伝学研究所・教授)
09/14 木村先生歓迎会BBQ at 中庭

09/20 ミーティング+掃除:松尾・飯星・袰川・中間・柳井
09/26 ミーティング+掃除:松尾・飯星・袰川・中間・岡田

10月 *後学期の開始です!

10/03 JC#1柳井:松尾・中間・袰川・飯星・岡田+ミーティング+掃除:
     Social amoebae trap and kill bacteria by casting DNA nets.
     Zhang X, Zhuchenko O, Kuspa A, Soldati T. 
     Nat Commun. 2016 Mar 1;7:10938. doi: 10.1038/ncomms10938.
10/10 (祝日のためJCはお休みです)
10/11 (火)PR2 岡田、袰川、柳井、飯星、松尾、中間
     +掃除+焼き芋の会
10/17 JC#2 松尾:柳井・中間・袰川・飯星+ミーティング+掃除
     Compositional Control of Phase-Separated Cellular Bodies.
     Banani SF, Rice AM, Peeples WB, Lin Y, Jain S, Parker R,
     Rosen MK. Cell. 2016 Jul 28;166(3):651-63.
     doi: 10.1016/j.cell.2016.06.010. Epub 2016 Jun 30.
10/24 JC#3中間:松尾・袰川・*柳井+ミーティング+掃除:
     Global quantification of mammalian gene expression control. Schwanhausser B, Busse D, Li N, Dittmar G,
     Schuchhardt J, Wolf J, Chen W, Selbach M. Nature. 2011 May 19;473(7347):337-42. doi: 10.1038/nature10098. 10/31 JC#4袰川:松尾・中間・飯星+ミーティング+掃除
     A recursive vesicle-based model protocell with a primitive model cell cycle. Kurihara K, Okura Y, Matsuo M,
     Toyota T, Suzuki K, Sugawara T. Nat Commun. 2015 Sep 29;6:8352. doi: 10.1038/ncomms9352.

11月


11/07  9:30- ミーティング+掃除:松尾・柳井・袰川・飯星・*中間
     1:00- PR2 松尾・中間・柳井・飯星・袰川
11/14  JC#5飯星:松尾・中間・袰川・*柳井+ミーティング+掃除
     Amyloid-like Self-Assembly of a Cellular Compartment.
     Boke E, Ruer M, Wuhr M, Coughlin M, Lemaitre R, Gygi SP,
     Alberti S, Drechsel D, Hyman AA, Mitchison TJ. Cell.
     2016 Jul 28;166(3):637-50. doi: 10.1016/j.cell.2016.06.051.
11/18  クリスマスツリー登場
11/21  JC#6柳井:袰川・飯星・中間・*松尾+ミーティング
     +掃除
     Nucleic acid sensing by T cells initiates Th2 cell
     differentiation. Imanishi T, Ishihara C, Badr Mel S,
     Hashimoto-Tane A, Kimura Y, Kawai T, Takeuchi O,
     Ishii KJ, Taniguchi S, Noda T, Hirano H, Brombacher F,
     Barber GN, Akira S, Saito T. Nat Commun. 2014 Apr
     10;5:3566. doi: 10.1038/ncomms4566
11/28  JC#7松尾:柳井・中間・袰川・飯星+ミーティング+掃除
     Puromycin-based vectors promote a ROS-dependent
     recruitment of PML to nuclear inclusions enriched with
     HSP70 and Proteasomes. Moran DM, Shen H, Maki CG.
     BMC Cell Biol. 2009 May 1;10:32. doi: 10.1186/
     1471-2121-10-32.
11/29  分子生物学会の発表予行:
     斉藤・柳井・袰川・飯星

12月

11/30-12/02 第39回日本分子生物学会(パシフィコ横浜)

  • ・2P-0007 SUMO依存型ユビキチンE3リガーゼRNF4によるユビキチン修飾と細胞機能の制御
    Regulation of the ubiquitinylation pathway and cellular function by the SUMO-targeted ubiquitin E3 ligase RNF4.
    魚住 直毅 、松本 蛍、湯浅 映里 、桝田 実沙妃、○斉藤 寿仁
  • ・2P-0008 抗がん剤aclarubicinの細胞毒性はSUMO・ユビキチン修飾と核およびミトコンドリアの制御破綻に由来する
    Aclarubicin, an anthracycline anti-cancer drug, gives fluorescence and contrasts the mitochondria: an implication of novel acralubicin cytotoxicity.
    ○飯星はるか、黒田将吾、石原孝也、石原直忠、斉藤寿仁
  • ・2P-0009 ヒト白血病細胞株HL-60を用いた分葉核と細胞外クロマチンネットワークの形成過程の分子制御に関する研究
    Verification about extracellular chromatin of HL-60 induced by tunicamycin
    ○柳井良平、中山智文、斉藤寿仁
  • ・2P-0010 Giant Plasma Membrane Vesicles(GPMV)の効率的な生成条件と核・クロマチン相互作用の解析
    Elucidation of the conditions for efficient gereation of giant plasma membrane vesicles and analyses on the GPMV interaction with the nucleus and chromatin
    ○袰川 智吏、斉藤寿仁
    *優秀ポスター賞を受賞しました!おめでとう!

12/05 JC#8 中間:松尾・柳井・袰川・飯星
    +ミーティング+掃除
    UBQLN2 Mediates Autophagy-Independent
    Protein Aggregate Clearance by the
    Proteasome. Hjerpe R, Bett JS, Keuss MJ,
    Solovyova A, McWilliams TG, Johnson C,
    Sahu I, Varghese J, Wood N, Wightman M,
    Osborne G, Bates GP, Glickman MH,
    Trost M, Knebel A, Marchesi F, Kurz T.
    Cell. 2016 Aug 11;166(4):935-49.
    doi: 10.1016/j.cell.2016.07.001.
12/06 鉾結衣さん、中田龍太郎君、
    村上智洋君、鎗水秀虎君がH29年度の
    卒研メンバーとして仮配属されました。
    活躍を期待しています!
12/06 学会報告会
    by 斉藤・柳井・袰川・飯星+松尾・中間・
    鉾・中田・村上・鎗水
12/12 PR2+ミーティング+掃除:柳井・袰川・飯星・松尾・中間・鉾・中田・村上・鎗水
12/13 3〜 5時限目 石原直忠 先生(久留米大学 分子生命科学研究所 高分子化学研究部門 教授)「ミトコンドリアと
    オートファジーによる細胞機能制御と疾患」
12/19 9:30〜 JC#9 袰川+ミーティング+掃除:飯星・松尾・中間・鉾・中田・村上・鎗水 
    A fusogenic peptide from a sea urchin fertilization protein promotes intracellular delivery of biomacromolecules by
    facilitating endosomal escape. Niikura K, Horisawa K, Doi N. J Control Release. 2015 Aug 28;212:85-93.


12/21(水)3〜5時限目 石原・斉藤「ミトコン
    ドリアとオートファジーによる細胞機能
    制御と疾患」+石原先生の歓迎会+新
    メンバー歓迎会 at C216
12/22(木)3時限目・特別公開授業#1石原
    先生の研究セミナー「ミトコンドリアの
    ダイナミクスと細胞機能制御」4〜5時
    限目・#2:石原、高野、斉藤の討論
    会「共生する作法〜細胞内オルガネ
    ラ研究から見える生物の協調性と寛
    容性」
12/26 9:30〜 JC#10飯星+ミーティング+
    大掃除:袰川・松尾・中間・鉾・中田
    ・村上・鎗水・*柳井
    MAPL SUMOylation of Drp1
    Stabilizes an ER/Mitochondrial
    Platform Required for Cell Death.
    Prudent J, Zunino R, Sugiura A,
    Mattie S, Shore GC, McBride HM. Mol
    Cell. 2015 Sep 17;59(6):941-55.

1月

01/10 ミーティング+掃除:袰川・柳井・飯星・松尾・中間・鉾
     村上・鎗水
     初詣(藤崎八幡宮):鉾・村上・鎗水
     PR2
01/16 ミーティング+掃除:袰川・飯星・松尾・中間・鉾・村上・
     鎗水・中田
01/23 ミーティング+掃除:袰川・中間・飯星・松尾・村上・鎗水・
     *柳井
01/27 研究室での卒論締め切り〜斉藤に提出
01/30 ミーティング+掃除: 袰川・柳井・飯星・松尾・中間・鉾・
     村上・中田・鎗水*

2月

02/03 卒論締め切り(〜17時までに生物事務室)
02/04 卒研発表予行#1:松尾・村上
02/06 研究室での発表予行#2
     +ミーティング+掃除
02/06 JFR説明会:岡田さんが発表しました!
02/04 卒研発表予行#3
02/09-10 卒論発表会
02/10 15:14〜 袰川
      15:26〜 柳井
      15:38〜 中間
      16:15〜 松尾
      16:27〜 飯星
02/10 シャンペンと苺で打ち上げ at C216

02/13 ミーティング+掃除: 袰川・飯星・松尾・中間・柳井・鉾・中田・鎗水・岡田
02/14 坂本さん(山形大)、早川・坂根さん(並木精密宝石)来熊セミナー
   熊本風お好み焼きで歓迎会 at C216

02/16 修士論文発表会 at D201

02/17 歓送会(追いコン) at くすの木会館
*飯星さんと袰川さんが卒研発表で
ベストプレゼン賞を受賞しました!おめでとう!

02/20 pre-JC&基礎購読・中田+飯星・鉾・鎗水:ミーティング+掃除
    Nuclear Localization of Mitochondrial TCA Cycle Enzymes as a Critical Step in Mammalian Zygotic Genome
    Activation. Nagaraj R, Sharpley MS, Chi F, Braas D, Zhou Y, Kim R, Clark AT, Banerjee U. Cell.
    2017 Jan 12;168(1-2):210-223.e11. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.026.
02/27 pre-JC&基礎購読・鎗水+飯星・鉾・中田・村上・岡田+ミーティング+掃除
    Nuclear Localization of Mitochondrial TCA Cycle Enzymes as a Critical Step in Mammalian Zygotic Genome
    Activation. Nagaraj R, Sharpley MS, Chi F, Braas D, Zhou Y, Kim R, Clark AT, Banerjee U. Cell.
     2017 Jan 12;168(1-2):210-223.e11. doi: 10.1016/j.cell.2016.12.026.

3月

03/06 pre-JC&基礎購読・村上+ミーティング+掃除
    Compartment-specific aggregases direct distinct nuclear and cytoplasmic aggregate deposition. Miller SB, Ho CT,
    Winkler J, Khokhrina M, Neuner A, Mohamed MY, Guilbride DL, Richter K, Lisby M, Schiebel E, Mogk A, Bukau B.
    EMBO J. 2015 Mar 12;34(6):778-97. doi: 10.15252/embj.201489524.
03/13 pre-JC&基礎購読・高鉾+ミーティング+掃除
    Dynamic Remodeling of Membrane Composition Drives Cell Cycle through Primary Cilia Excision. Phua SC, Chiba S,
    Suzuki M, Su E, Roberson EC, Pusapati GV, Setou M, Rohatgi R, Reiter JF, Ikegami K, Inoue T. Cell.
    2017 Jan 12;168(1-2):264-279.e15. 03/25 卒業式「卒業おめでとう!」*卒業生からホットサンドメーカー!

03/27 pre-JC&基礎購読・岡田+ミーティング+掃除
    Assembly of a nucleus-like structure during viral replication in bacteria. Chaikeeratisak V, Nguyen K, Khanna K,
    Brilot AF, Erb ML, Coker JK, Vavilina A, Newton GL, Buschauer R, Pogliano K, Villa E, Agard DA, Pogliano J. Science.
    2017 Jan 13;355(6321):194-197.